Se crea en 2011 en el Sistema de Centros Regionales Universitarios para organizar sus acciones de investigación y darles mayor proyección, calidad e impacto. La investigación en el modelo educativo de centros regionales está anclado en su vocación transformadora que se expresa en la articulación de la teoría con la práctica, el enfoque interdisciplinario, derivado de la integralidad de la problemática del medio rural, trabajo en equipo y vinculación con la realidad compleja del país.

Instituto de investigación que contribuye a la formación de profesionistas e investigadores a nivel posgrado y la vinculación con organizaciones e instituciones del medio rural. Con pertinencia social y científica, capaz de responder con propuestas viables e innovadoras a la problemática del desarrollo rural regional del país, líder en el estudio de la diversidad de la agricultura mexicana, y desarrollando investigación interdisciplinaria, original y de calidad reconocida en México y a nivel internacional.